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科技创“芯”|秦宝芯1.0低密度育种芯片成功研发

为加速“秦宝牛”分子育种进程,提升选育效率和准确性,秦宝牧业、西北农林科技大学、杨凌牛业公司联合北京康普森农业科技有限公司成功研发出适用于秦宝牛育种的第一代芯片——秦宝芯1.0低密度育种芯片。

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秦宝芯1.0低密度育种芯片是以5个肉牛品种为基础,选择500余头个体开展全基因组重测序,与其它品种进行比对鉴定,通过对开发的高质量SNP进行严格过滤、筛选,最终得到含近25,000个SNP位点的基因芯片,包含秦川牛、安格斯牛、和牛、西门塔尔牛和荷斯坦牛等品种特异性分子标记位点。其25K SNP位点经过高深度测序、严格筛选、科学设计而获得,具有多态性高、检出率高、基因组分布均匀等特点。测试与评估显示,秦宝芯1.0低密度育种芯片的平均位点检出率大于99.23%,且基因分型稳定性好,重复样本基因型一致率超过99.61%。

秦宝芯1.0低密度育种芯片作为秦宝牛新品种培育过程中的第一款育种芯片,适用于秦宝牛的品种鉴定、基因组选择育种、重要经济性状基因定位、亲子鉴定、家系构建等领域,为秦宝牛基因组育种研究提供强有力的技术支撑,对于加速秦宝牛选育进展具有重要意义。


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